南海及印度洋是世界生物多样性热点区域，也是许多经济动、植物的原产地和发源地，在我国的国民经济和农业生产方面具有十分重要的地位和作用。泛南海及印度洋海洋动、植物和微生物资源也已成为国家重要的战略资源。海洋的竞争归根结底是海洋资源的竞争，如何获取更多的资源、应用绿色技术手段综合利用海洋生物资源，是人类建设生态文明、持续发展和谐社会所面临的重要科学问题。新型海洋生物资源是陆生生物及化学资源的重要替代品，是21世纪可持续发展的重要保证。海洋生物功能物质对现代医药产业发展和产业调整具有决定性的推进作用，加强海洋微生物组合生物合成和合成生物学技术的研究，促进创新药物、环保产品和微生物工业酶的发展，是实现现代生物技术产业健康、快速、和谐发展的重要基础。
成立海洋生物工程研究中心，开展重要热带海洋经济动物的基因工程育种，创制海洋生物（鱼、虾、贝类、海藻、功能微生物、海参、海马等等）新品种，优化品种性状和免疫抗病能力发展海洋生物的工厂化高效生态养殖新技术，构建热带特色海洋牧场。针对热带海洋微生物的物种、遗传和代谢多样性特征，革新选择性分离和保藏海洋微生物菌种技术，提高富集深远海微生物的效率，建设热带特色海洋药源微生物资源库；充分挖掘热带海洋特色微生物和代谢产物资源，发现具有显著生理生态效应的活性物质和功能产品，利用合成生物学技术拓展代谢产物库，开发具有自主知识产权的抗感染、抗肿瘤和抗心血管疾病的海洋微生物代谢产物，筛选创新药物先导化合物。拓展海洋生物的高值化利用能力，开发营养品、功能食品、保健品和化妆品等高附加值产品，综合利用海洋微生物工业酶进行海洋生物制品的精深加工，发展海洋微藻能源等。
